Генетический секвенатор MiSeq SY-410-1003, Illumina

Обеспечивает возможность мультиплексирования за счет смешивания образцов в одной пробе - до 96 с помощью комбинации мультиплексных идентификаторов с каждого конца при парно-концевых чтениях (8х12); реагенты TruSeq реализуют метод обратимого терминального включения флуоресцентно-меченного основания, позволяют детектировать сигнал от отдельного нуклеотида, после чего терминатор удаляется; для приготовления shotgun-библиотек имеется специально разработанный набор реагентов Nextera для фрагментирования ДНК на основе фермента транспозазы; метод пробоподготовки и проведения клональной амплификации - с использованием эмульсионной ПЦР или без использования эмульсионной ПЦР (на выбор); необходимое количество ДНК образца для секвенирования - 50 нг (реагенты Nextera) / от 100 нг до 1 мкг (реагенты TruSeq) / от 1 нг геномной ДНК; количество различных ампликонов, анализируемых за один запуск прибора - до 36’000; обработка полученных данных осуществляется первоначально непосредственно ПО прибора и занимает от 2 ч (парно-концевые чтения 2 х 250) до 24 ч (метагеномный анализ по 16S РНК), после чего биоинформатическая обработка данных может осуществляться с помощью бесплатного защищенного облачного сервиса BaseSpace (порядка 8 ч), для которого требуется только доступ в Интернет.