Программный комплекс фильтрации повторяющихся последовательгостей (рипитов) в ридах NGS Illumina
Первухин Сергей Васильевич
14 сентября 2018
371
| Предметная область | — |
| Отрасли по ОКВЭД | — |
| Страна, регион, город | Российская Федерация, Красноярский край, Красноярск |
| Отличия от конкурентов | — |
| Вид документа об охране ИС | программа для ЭВМ |
| Номер документа ИС | 201561917 |
| Дата регистрации документа ИС | 2015-09-20 |
| Необходимые инвестиции для внедрения | договорная |
| Сроки внедрения | — |
| Стоимость предоставления технологии | договорная |
| Наличие экспертного заключения | Нет |
Польза для потенциального потребителя
Программа предназначена для использования в качестве одного из этапов подготовки геномных данных к этапу ассемблирования с сохранением последовательностей, кодирующих белки. Программа позволяет: выделять рипиты из исходных данных (ридов); кластеризовать риды по признаку «похожести»; выводить статусы выполнения программы для обеспечения совместимости с системами пакетного выполнения задач; генерировать отчет по выполненной фильтрации; обрабатывать большие массивы данных (более 250 Гб на файл); использовать оптимизацию памяти для количества ридов в пределах 4-8 млрд. с использованием 33-битовых целых чисел; использовать вычислительные возможности многопроцессорных архитектур