Программный комплекс фильтрации повторяющихся последовательгостей (рипитов) в ридах NGS Illumina

Первухин Сергей Васильевич
14 сентября 2018
116
Предметная область
Отрасли по ОКВЭД
Страна, регион, город Российская Федерация, Красноярский край, Красноярск
Отличия от конкурентов
Вид документа об охране ИС программа для ЭВМ
Номер документа ИС 201561917
Дата регистрации документа ИС 2015-09-20
Необходимые инвестиции для внедрения договорная
Сроки внедрения
Стоимость предоставления технологии договорная
Наличие экспертного заключения Нет

Польза для потенциального потребителя

Программа предназначена для использования в качестве одного из этапов подготовки геномных данных к этапу ассемблирования с сохранением последовательностей, кодирующих белки. Программа позволяет: выделять рипиты из исходных данных (ридов); кластеризовать риды по признаку «похожести»; выводить статусы выполнения программы для обеспечения совместимости с системами пакетного выполнения задач; генерировать отчет по выполненной фильтрации; обрабатывать большие массивы данных (более 250 Гб на файл); использовать оптимизацию памяти для количества ридов в пределах 4-8 млрд. с использованием 33-битовых целых чисел; использовать вычислительные возможности многопроцессорных архитектур