Система визуализации синтенных блоков и сравнения геномных сборок (СиГраф) / System for visualization of synteny alignments and comparison of assembly contigs (SyGraph)
Байбородин Сергей Иванович
14 сентября 2018
331
| Предметная область | — |
| Отрасли по ОКВЭД | — |
| Страна, регион, город | Российская Федерация, Новосибирская область, Новосибирск |
| Отличия от конкурентов | — |
| Вид документа об охране ИС | программа для ЭВМ |
| Номер документа ИС | 201666298 |
| Дата регистрации документа ИС | 2016-11-28 |
| Необходимые инвестиции для внедрения | договорная |
| Сроки внедрения | — |
| Стоимость предоставления технологии | договорная |
| Наличие экспертного заключения | Нет |
Польза для потенциального потребителя
Разработанная программа осуществляет визуализацию выравнивания геномных сборок, состоящих из большого количества контигов, используя метод, основанный на графах. Программа имеет веб-интерфейс и может быть установлена на серверах под управлением ОС Linux. Программа позволяет производить визуальный сравнительный анализ различных биологических видов, что может способствовать решению таких задач сравнительной геномики, как: идентификация структуры и функции генов, выявление регуляторных последовательностей и взаимодействий между продуктами генов.