Система визуализации синтенных блоков и сравнения геномных сборок (СиГраф) / System for visualization of synteny alignments and comparison of assembly contigs (SyGraph)

Байбородин Сергей Иванович
14 сентября 2018
202
Предметная область
Отрасли по ОКВЭД
Страна, регион, город Российская Федерация, Новосибирская область, Новосибирск
Отличия от конкурентов
Вид документа об охране ИС программа для ЭВМ
Номер документа ИС 201666298
Дата регистрации документа ИС 2016-11-28
Необходимые инвестиции для внедрения договорная
Сроки внедрения
Стоимость предоставления технологии договорная
Наличие экспертного заключения Нет

Польза для потенциального потребителя

Разработанная программа осуществляет визуализацию выравнивания геномных сборок, состоящих из большого количества контигов, используя метод, основанный на графах. Программа имеет веб-интерфейс и может быть установлена на серверах под управлением ОС Linux. Программа позволяет производить визуальный сравнительный анализ различных биологических видов, что может способствовать решению таких задач сравнительной геномики, как: идентификация структуры и функции генов, выявление регуляторных последовательностей и взаимодействий между продуктами генов.