Параллельная версия задачи «молекулярная динамика», вариант для эмулятора

14 сентября 2018
190
Предметная область
Отрасли по ОКВЭД
Страна, регион, город Российская Федерация, Москва
Отличия от конкурентов
Вид документа об охране ИС программа для ЭВМ
Номер документа ИС 201661011
Дата регистрации документа ИС 2016-01-11
Необходимые инвестиции для внедрения договорная
Сроки внедрения
Стоимость предоставления технологии договорная
Наличие экспертного заключения Нет

Польза для потенциального потребителя

Программа предназначена для демонстрации работы полностью асинхронного алгоритма, опирающегося исключительно на локальные взаимодействия между вычислительными ядрами, ответственными за соседние области в новой парадигме вычислений. При решении задачи молекулярной динамики одним экземпляром узла рассчитывается шаг эволюции одной частицы. Каждая частица взаимодействует с набором близких частиц, расположенных в пределах сферы с радиусом отсечения Rс. Взаимодействие между частицами реализуется через механизм посылки токенов и их взаимодействия в ассоциативной памяти по принципу: одна частица - один токен. Токены являются основными информационными объектами, с которыми работает аппаратура нашей вычислительной системы. Распараллеливание основано на принципе пространственной декомпозиции, когда каждое вычислительное ядро обрабатывает частицы, находящиеся в его собственной области пространства - кубоиде. Каждый кубоид импортирует частицы от соседних кубоидов, обрабатывает попарные взаимодействия и экспортирует вычисленную суммарную силу, действующую на каждую из принятых частиц, в ее кубоид. Программа позволяет продемонстрировать масштабируемость параллельной потоковой вычислительной системы на эмуляторе, который функционирует на высокопроизводительном кластере.