Программа интерактивного моделирования взаимодействия и конкуренции РНК-полимераз - RIVALS

Программа позволяет выполнять в интерактивном режиме компьютерное моделирование процесса транскрипции выбранного участка ДНК. Программа реализует модель регуляции экспрессии генов посредством взаимодействия и конкуренции РНК-полимераз и позволяет наблюдать и измерять экспрессию генов как в составе сравнительно коротких локусов, так и в целой макромолекуле ДНК, в том числе кольцевой. Программа предусматривает одновременное связывание РНК-полимераз бактериального и фагового типов с многочисленными промоторами, действие транскрипционных сигма-факторов, различные механизмы активации, репрессии и терминации транскрипции. Программа предназначена для проведения предварительных экспериментов, поиска перспективных участков генома, выбора параметров модели, планирования массового моделирования на суперкомпьютере, а также для учебных целей, но может служить и самостоятельным инструментом фундаментального научного исследования; позволяет изучать реакцию клетки и всего организма на мутации и неблагоприятные внешние воздействия, предсказывать новые, ранее неизвестные факторы транскрипции и механизмы генетических заболеваний.