Программа моделирования классической аттенюаторной регуляции - RNAMODEL

Программа позволяет моделировать процесс транскрипции регуляторной области структурного гена, выявляя при этом наличие (или отсутствие) монотонной зависимости уровня экспрессии этого гена от внутриклеточной концентрации определенных аминокислот. Такая зависимость характерна для классической аттенюаторной регуляции и некоторых других регуляторных механизмов у бактерий. Реализованная в программе модель согласуется с имеющимися данными биологических опытов, что позволяет использовать ее для предсказания наличия или отсутствия регуляции данного вида у других организмов, в том числе патогенных, прямые эксперименты с которыми затруднительны. Исследование регуляции на модели также позволяет изучать влияние точечных мутаций в регуляторных областях на экспрессию генов и делать предсказания об эволюционной устойчивости организмов, что важно для создания новых антибиотиков и определения мишеней для потенциального терапевтического воздействия.